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系統根據以上流程為不同種類儀器生成相應的樣品序列文件，并通過多種形式在儀器工作站軟件中導入，快捷簡便并避免出現錯誤，為儀器分析實驗過程開啟了一個全新的方式，根據目前市面銷售的各種儀器，NeptuneS3能夠非常輕松的適應數據類型的變換。
樣品注冊過程中錄入的樣品信息，可以在預定義模板的基礎上，將必要的信息都生成在樣品序列中，系統對于儀器的種類管理，各儀器的文件類型及格式管理都非常靈活，目前已經開發日本島津液相色譜工作站軟件序列生成模板，后續將不斷推出安捷倫，沃特世等多種儀器，多種軟件版本樣品序列模板，以滿足不同需求。 系統能夠與LIMS和ELN一同配合提供實驗室全流程樣品測試自動化要求。
